Englishm6A 甲基化测序（MeRIP-seq）完全指南
m6A（N6-甲基腺嘌呤）是真核生物 mRNA 上最常见、最丰富的内部修饰，参与调控 RNA 剪接、稳定性、翻译效率与降解。研究 m6A 全转录组分布的主流手段是 MeRIP-seq（m6A RNA 甲基化免疫沉淀测序）。本文系统讲清原理、送样、周期与开泰方案。
一、m6A 是什么，为什么要测
m6A 占全部腺嘌呤约 0.1%–0.4%，富集于 mRNA 的 3'UTR 与终止密码子附近，以及 lncRNA、circRNA 等。
功能上，m6A 影响 mRNA 出核、稳定性与翻译，与发育、免疫、肿瘤、干细胞分化等密切相关。
当研究问题涉及"转录后调控""为什么表达量变化不等于蛋白变化"，m6A 测序是首选切入点之一。
二、MeRIP-seq 原理与流程
RNA 质控与片段化：总 RNA 检测 RIN 与浓度，打断至合适片段。
m6A 抗体富集：用抗 m6A 抗体免疫沉淀带修饰片段（保留 Input 作背景对照）。
文库构建与测序：富集片段建库，高通量测序（通常 PE150）。
峰值识别与注释：比对参考基因组，peak-calling（MACS2 / exomePeak2 / MeTPeak）识别 m6A 峰，注释到基因、motif（典型 RRACH）与功能区域。
三、送样要求
样本类型：总 RNA 或新鲜/冻存细胞、组织（液氮速冻后 -80℃ 保存）。
RNA 质量：RIN ≥ 8.0（动物）；植物/微生物可适当放宽但需评估。
RNA 总量：动物样本 ≥ 5 μg。
生物学重复：建议 ≥ 3 次。
对照：Input 文库必做。
四、项目周期
标准项目整体约 2–4 周：质控片段化（2–3 天）→ 富集建库（5–7 天）→ 测序（5–10 天）→ 标准分析（3–5 天）。
五、数据分析
原始数据质控、比对、peak 识别与注释；差异 m6A 峰（DMAP）；motif 分析、功能富集；与表达量关联；开泰标准项目配套价值 2–5 万元免费高级分析。
六、多组学组合
m6A + RNA-seq：区分转录与修饰水平变化。
m6A + ATAC-seq / CUT&Tag：关联染色质开放性与表观调控。
m6A + 单细胞转录组：细胞类型分辨率下看修饰异质性（开泰 10x + 华大双平台）。
七、开泰方案
开泰生物提供 m6A RNA 甲基化测序（MeRIP-seq）全流程服务，可组合 ATAC-seq、CUT&Tag、ChIP-seq 与单细胞多组学。作为华大智造 DNBelab C 认证服务商，运营 10x + 华大双平台，标准项目配套免费高级分析（价值 2–5 万元）。
八、常见问题
Q：m6A 和 m6A-seq / MeRIP-seq 是一回事吗？ 基本同义，区别多在建库细节（如单碱基分辨率的 m6A-CLIP / miCLIP）。
Q：RIN 只有 7 可以测吗？ 建议补提或重新取样，RIN 偏低会明显影响富集效率与峰质量。
Q：没有临床样本能做吗？ 细胞系、模式动物、植物、微生物均可；临床人源需符合伦理与知情同意。
九、下一步
开泰生物技术团队提供免费送样咨询与实验设计。请致电 400-178-8899 或邮件 [email protected]。
